Ölüler Lisesi, günümüz Japonya'sında geçmektedir ve gezegenin insanları zombiye dönüştüren ölümcül bir salgının vurulmasıyla başlayarak, örtmece olarak ana karakterlerden "Onlar" (? Yatsura?)
Hikaye, bir dizi lise öğrencisini (ve aynı zamanda üniversite hemşiresini) "Salgın" olarak adlandırılan dünya çapında bir felaket olayıyla başa çıkarken takip ediyor. Oyuncular zombi kıyametinde hayatta kalmaya çalışırken, tehlikeli kurtulanlar türündeki sosyal düşüş riskleriyle ve belirli ahlaki kodlarının potansiyel çürümesiyle de yüzleşmek zorundadırlar. HS'den başlayarak, öğrenciler, öğrencileriyle ve kusurlu bir öğretmenle başa çıkmak zorunda oldukları yerde kasabaya kaçarlar. Küçük bir kızın yanı sıra bir köpek alırlar ve evlerinde hayatta kalanlar için değerlendirme yaparlar. Daha sonra, güvenli bölge olduğu iddia edilen bir ilkokula, bir polis karakoluna ve son olarak da bir alışveriş merkezine giderler.
