Kanon'un kışın ortasında geçen hikayesi, aynı çocuğa bağlanan beş kızdan oluşan bir grupla ilgilidir. Ana kahraman Yuichi Aizawa, hikayenin başlamasından yedi yıl önce hikayenin geçtiği şehri ziyaret etmişti.
Başlangıçta Yuichi, şehirden ve sakinlerinden çok bağımsız. Dönüşünden önce kuzeni Nayuki Minase ve annesi Akiko ile kalmasına karar verildi. Uzun süren yokluğundan sonra, Yuichi, yedi yıl önce olanların küçük detayları hariç neredeyse her şeyi unuttu ve geride bıraktığı şeyleri hatırlatmaya ihtiyaç duyuyor.
Yuichi'nin dönüşünün ertesi günü, ona kasabayı gezdiren Nayuki ile dışarı çıkar. Nayuki, akşam yemeği için bir şeyler satın alması gerektiğini hatırlar ve Yuichi, kaybolabileceğini savunarak onunla gitmek konusunda isteksizdir. Nayuki'nin onu kaldırımda bekletmesinden birkaç dakika sonra, Ayu Tsukimiya adında tuhaf bir kız küçük bir uyarı ile ona daldı. İyileştikten sonra, onu yakındaki bir kafeye sürükler ve ödeme şansı bulamadan satıcı tarafından yanlışlıkla korkutulduktan sonra yanlışlıkla taiyaki ile dolu bir çantayı çaldığını itiraf eder. Yuichi daha sonra Ayu'yu satıcıya geri sürükler, ikisi de sorun için özür diler ve Ayu affedilir. Başka bir gün tekrar buluşmaya karar verirler ve Ayu kaçar.
Yuichi ilk başta farkında değil, unutmuş olduğu diğer üç kız da ona aşinadır. Hikaye boyunca, kasabanın doğaüstü alt tonlarını öğrenirken, Yuichi her kıza ve yedi yıl önce karla kaplı şehirde olaylara hatırlatılır.
